生物信息数据分析和挖掘®

提供涵盖基因组信息、测序数据分析、全基因组关联分析、遗传育种数据整合挖掘、大数据计算、管理、检索等服务。

全基因组SNP分析及在育种上的应用

植物全基因重测序SNP分析,通过对不同群体或者个体进行测序和生物信息分析,揭示不同个体基因组存在的遗传变异,对测序群体或个体进行遗传变异差异分析,评估群体结构、遗传多样性;对功能基因开发分子标记等。
  • 高通量
  • 高密度
  • 高精度

全基因组关联分析(GWAS)

全基因组关联分析(GWAS)是指在植物全基因组范围内检测存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),基于它们与分析性状的连锁不平衡关系,通过各种统计分析方法,获得与性状关联的候选基因或基因组区域。
GWAS优势:
1. 无须构建特定的群体;
2. 可以同时对众多的材料围绕几乎任何性状(或遗传位点)开展研究;
3. 不涉及候选基因,所研究的基因可以是“未知”的;
4. 高通量,可以同时检测成千上万个序列,降低了大样本全基因组水平分析的成本 。
  • 变异多
  • 性状广
  • 定位全

RNA测序分析及在育种中的应用

通过RNA测序及相关验证实验等技术手段将定位到的抗病基因导入到高产的品种中,首先从种质资源中筛选出来的抗病品种,和其相同遗传背景的植株为对照进行RNA测序,分析基因型变异,可变剪切,转录本和基因在抗病过程中的表达差异,并对这些基因进行功能上的富集分析,鉴定出和抗病相关的核心基因集,通过严格的实验验证,确定和抗病相关的基因,然后通过各种生物学技术将抗病基因导入到高产的品种中,育成高产又抗病的品种。
  • 全面
  • 快速
  • 精确

混合分组分析(BSA)原理及其在育种中的应用

原理:选择目标性状表型极端差异的亲本构建家系,对两个亲本和两种极端表型的F2代群体分别进行全基因组重测序,检测子代1和子代2间DNA差异片段,进一步定位到目标性状相关的基因。

应用:快速定位单基因质量性状基因或数量性状主效基因,加速作物育种进程,大大缩短育种年限。
  • 快速
  • 经济
  • 准确